MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 1179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012177	A	6	6	646	651	100 %	0 %	0 %	0 %	224984382
2	NC_012177	ATATTA	2	12	658	669	50 %	50 %	0 %	0 %	224984382
3	NC_012177	TAA	2	6	744	749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984382
4	NC_012177	A	8	8	763	770	100 %	0 %	0 %	0 %	224984382
5	NC_012177	ATTT	2	8	794	801	25 %	75 %	0 %	0 %	224984382
6	NC_012177	TGG	2	6	843	848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984382
7	NC_012177	ATT	2	6	901	906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984382
8	NC_012177	TAGGAG	2	12	947	958	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	224984382
9	NC_012177	TTA	2	6	992	997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984382
10	NC_012177	A	7	7	1036	1042	100 %	0 %	0 %	0 %	224984382
11	NC_012177	TTA	2	6	1122	1127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984382
12	NC_012177	A	7	7	1463	1469	100 %	0 %	0 %	0 %	224984383
13	NC_012177	ATT	2	6	1472	1477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984383
14	NC_012177	A	8	8	1513	1520	100 %	0 %	0 %	0 %	224984383
15	NC_012177	TAA	2	6	1522	1527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984383
16	NC_012177	AAT	2	6	1538	1543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984383
17	NC_012177	GAA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984383
18	NC_012177	AAATC	2	10	1577	1586	60 %	20 %	0 %	20 %	224984383
19	NC_012177	TGA	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984383
20	NC_012177	GAATT	2	10	1602	1611	40 %	40 %	20 %	0 %	224984383
21	NC_012177	ACA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984383
22	NC_012177	TAA	2	6	1638	1643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984383
23	NC_012177	AAATT	2	10	1646	1655	60 %	40 %	0 %	0 %	224984383
24	NC_012177	ATG	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984383
25	NC_012177	TTA	2	6	1697	1702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984383
26	NC_012177	TAG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984383
27	NC_012177	AGA	2	6	1771	1776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984383
28	NC_012177	AGA	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984383
29	NC_012177	AAAAGA	2	12	1858	1869	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224984383
30	NC_012177	TAA	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984383
31	NC_012177	TA	3	6	1972	1977	50 %	50 %	0 %	0 %	224984383
32	NC_012177	CTT	2	6	2085	2090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984384
33	NC_012177	TTTTA	2	10	2122	2131	20 %	80 %	0 %	0 %	224984384
34	NC_012177	ATT	2	6	2144	2149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984384
35	NC_012177	T	7	7	2148	2154	0 %	100 %	0 %	0 %	224984384
36	NC_012177	T	6	6	2200	2205	0 %	100 %	0 %	0 %	224984384
37	NC_012177	ACT	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984384
38	NC_012177	TCC	2	6	2374	2379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224984384
39	NC_012177	CTC	3	9	2385	2393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224984384
40	NC_012177	TCA	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984384
41	NC_012177	ATT	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984384
42	NC_012177	GCATA	2	10	2496	2505	40 %	20 %	20 %	20 %	224984384
43	NC_012177	ATTT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	224984384
44	NC_012177	T	8	8	2803	2810	0 %	100 %	0 %	0 %	224984384
45	NC_012177	CCTAG	2	10	2813	2822	20 %	20 %	20 %	40 %	224984384
46	NC_012177	ACT	2	6	2845	2850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984384
47	NC_012177	CT	3	6	2849	2854	0 %	50 %	0 %	50 %	224984384
48	NC_012177	ATT	2	6	2869	2874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984384
49	NC_012177	CAA	2	6	2885	2890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984384
50	NC_012177	CAA	2	6	2904	2909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984384
51	NC_012177	T	6	6	3047	3052	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
52	NC_012177	TA	3	6	3074	3079	50 %	50 %	0 %	0 %	224984385
53	NC_012177	T	6	6	3089	3094	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
54	NC_012177	TAA	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984385
55	NC_012177	AATC	2	8	3158	3165	50 %	25 %	0 %	25 %	224984385
56	NC_012177	TTC	2	6	3166	3171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984385
57	NC_012177	ATTT	2	8	3211	3218	25 %	75 %	0 %	0 %	224984385
58	NC_012177	CAT	2	6	3250	3255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
59	NC_012177	T	6	6	3314	3319	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
60	NC_012177	ATC	2	6	3326	3331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
61	NC_012177	TCT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984385
62	NC_012177	AAG	2	6	3473	3478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984385
63	NC_012177	ACT	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
64	NC_012177	TTG	2	6	3500	3505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984385
65	NC_012177	T	6	6	3514	3519	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
66	NC_012177	CAA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984385
67	NC_012177	CCG	2	6	3549	3554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224984385
68	NC_012177	TAAA	2	8	3569	3576	75 %	25 %	0 %	0 %	224984385
69	NC_012177	TTG	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984385
70	NC_012177	TCT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984385
71	NC_012177	AAT	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984385
72	NC_012177	TCAA	2	8	3645	3652	50 %	25 %	0 %	25 %	224984385
73	NC_012177	AGA	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984385
74	NC_012177	ATCA	2	8	3707	3714	50 %	25 %	0 %	25 %	224984385
75	NC_012177	TCA	2	6	3762	3767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
76	NC_012177	CCA	2	6	3783	3788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224984385
77	NC_012177	TCA	2	6	3804	3809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
78	NC_012177	CAT	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
79	NC_012177	ATC	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984385
80	NC_012177	TTA	2	6	4131	4136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984385
81	NC_012177	T	8	8	4154	4161	0 %	100 %	0 %	0 %	224984385
82	NC_012177	TCT	3	9	4209	4217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984385
83	NC_012177	AAG	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984385
84	NC_012177	TAA	2	6	4255	4260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984385
85	NC_012177	CAT	2	6	4545	4550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984386
86	NC_012177	T	6	6	4553	4558	0 %	100 %	0 %	0 %	224984386
87	NC_012177	TAG	3	9	4587	4595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984386
88	NC_012177	TGC	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984386
89	NC_012177	CAT	2	6	4671	4676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984386
90	NC_012177	AAC	2	6	4726	4731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984386
91	NC_012177	AGCA	2	8	4735	4742	50 %	0 %	25 %	25 %	224984386
92	NC_012177	TTTTA	2	10	4747	4756	20 %	80 %	0 %	0 %	224984386
93	NC_012177	ATTTAA	2	12	4762	4773	50 %	50 %	0 %	0 %	224984386
94	NC_012177	ACT	2	6	4795	4800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984386
95	NC_012177	A	6	6	4822	4827	100 %	0 %	0 %	0 %	224984386
96	NC_012177	CTT	2	6	4833	4838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984386
97	NC_012177	TCA	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984386
98	NC_012177	AGA	2	6	4900	4905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984386
99	NC_012177	AAT	2	6	4941	4946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984386
100	NC_012177	AAT	2	6	4967	4972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984386
101	NC_012177	ATA	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984386
102	NC_012177	T	7	7	4992	4998	0 %	100 %	0 %	0 %	224984386
103	NC_012177	CGA	2	6	5186	5191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984387
104	NC_012177	GAA	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984387
105	NC_012177	AAC	2	6	5251	5256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984387
106	NC_012177	GAAA	2	8	5294	5301	75 %	0 %	25 %	0 %	224984387
107	NC_012177	T	9	9	5375	5383	0 %	100 %	0 %	0 %	224984387
108	NC_012177	TTA	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984387
109	NC_012177	ACAATA	2	12	5445	5456	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	224984387
110	NC_012177	A	6	6	5541	5546	100 %	0 %	0 %	0 %	224984388
111	NC_012177	AGA	2	6	5551	5556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984388
112	NC_012177	A	8	8	5568	5575	100 %	0 %	0 %	0 %	224984388
113	NC_012177	ATA	2	6	5630	5635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984388
114	NC_012177	ACAA	2	8	5658	5665	75 %	0 %	0 %	25 %	224984388
115	NC_012177	T	6	6	5688	5693	0 %	100 %	0 %	0 %	224984388
116	NC_012177	AGA	2	6	5734	5739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984388
117	NC_012177	TAC	2	6	5856	5861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984388
118	NC_012177	A	7	7	5886	5892	100 %	0 %	0 %	0 %	224984388
119	NC_012177	GCAA	2	8	5926	5933	50 %	0 %	25 %	25 %	224984388
120	NC_012177	TATAC	2	10	5934	5943	40 %	40 %	0 %	20 %	224984388
121	NC_012177	AAAC	2	8	5992	5999	75 %	0 %	0 %	25 %	224984388
122	NC_012177	A	9	9	6006	6014	100 %	0 %	0 %	0 %	224984388
123	NC_012177	A	6	6	6038	6043	100 %	0 %	0 %	0 %	224984388
124	NC_012177	ACA	2	6	6126	6131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984388
125	NC_012177	ATT	2	6	6203	6208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984388
126	NC_012177	A	6	6	6245	6250	100 %	0 %	0 %	0 %	224984388
127	NC_012177	A	8	8	6259	6266	100 %	0 %	0 %	0 %	224984388
128	NC_012177	ATG	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984388
129	NC_012177	ATT	3	9	6329	6337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984388
130	NC_012177	ACAA	2	8	6344	6351	75 %	0 %	0 %	25 %	224984388
131	NC_012177	ACT	2	6	6355	6360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984388
132	NC_012177	A	6	6	6451	6456	100 %	0 %	0 %	0 %	224984389
133	NC_012177	CAAT	2	8	6500	6507	50 %	25 %	0 %	25 %	224984389
134	NC_012177	TAA	2	6	6542	6547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984389
135	NC_012177	A	6	6	6577	6582	100 %	0 %	0 %	0 %	224984389
136	NC_012177	ATT	2	6	6619	6624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984389
137	NC_012177	TGA	2	6	6648	6653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984389
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